從字面上理解，森林腦炎意味著該病在森林地區更為常見，并且是由森林中的病毒感染引起的。 在我國東北和其他國家的森林地區更常見。 該病很嚴重，發展時間從兩天到一個多月不等，有嚴重的后遺癥。
1、全身中毒癥狀：高熱時伴頭痛、全身肌肉痛、無力、食欲缺乏、惡心、嘔吐等，并由于血管運動中樞的損害，患者還可出現面部、頸部潮紅，結膜充血，脈搏緩慢。部分重癥患者有心肌炎表現，常有心音低鈍，心率增快，心電圖檢查有T波改變。嚴重患者可以突然出現心功能不全，急性肺水腫等。
2、意識障礙和精神損害：約半數以上患者有不同程度神志、意識變化，如昏睡、表情淡漠、意識模糊、昏迷，亦可出現譫妄和精神錯亂。
3、腦膜受累的表現：最常見的癥狀是劇烈頭痛，以顳部及后枕部持續鈍痛多見，有時為爆炸性和搏動性，呈撕裂樣全頭痛，伴惡心、嘔吐、頸項強直，腦膜刺激征。一般持續5～10天，可和昏迷同時存在，當意識清醒后，還可持續存在1周左右。
4、肌肉癱瘓：以頸肌及肩胛肌與上肢聯合癱瘓最多見，下肢肌肉和顏面肌癱瘓較少，癱瘓多呈弛緩型，此與乙型腦炎不同。一般出現在病程第2～5天，大多數患者經2～3周后逐漸恢復，少數留有后遺癥而出現肌肉萎縮，成為殘廢。由于頸肌和肩胛肌癱瘓而出現本病特有頭部下垂表現，肩胛肌癱瘓時，手臂搖擺無依狀態。
5、神經系統損害的其他表現：部分患者出現錐體外系統受損征，如震顫、不自主運動等。偶爾可見語言障礙、吞咽困難等延髓麻痹癥狀，或中樞性面神經和舌下神經的輕癱。
6、恢復期此期持續平均10～14天，體溫下降，肢體癱瘓逐步恢復，神志轉清，各種癥狀消失。
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