消化系統畸形屬于先天性畸形。 對于嬰兒，這種畸形可能會發生。 當發生此類畸形時，患者通常主要表現出一些癥狀。 最常見的是嘔吐和腹痛。 如果發生誤診，或者沒有立即開始治療，可能會給患者造成嚴重的疾病，甚至嚴重危及生命，因此有必要立即開始治療。
消化系統畸形嬰兒的主要表現1、出世后嘔吐并呈特發性加劇，或排泄物中帶有淺綠色液體。2、腹脹，并呈特發性加劇，可伴隨嘔吐或大便出現異常。3、出世后胎便排出來出現異常（一切正常新生兒出生后24鐘頭內有胎便排出來，2～3天排干凈）。
確診伴隨著產前檢查技術實力的提升，愈來愈多的消化系統畸型在臨產前就足以確診。如產前檢查發覺孕婦羊水增加、擴大的食道盲端、出現異常擴大的胃泡、十二指腸梗塞、出現異常擴大的腸道、腸道疝入胸腔（膈疝）等狀況，需高寬比警醒先天消化系統畸型的可能；
另有一部分腹部囊性包塊，比如膽總管囊腫、卵巢囊腫等也經常在產前發覺。不論是產前猜疑先天消化系統畸型，還是出世后出現外科性的嘔吐、腹脹等狀況，父母均應前去兒科或兒科醫院就醫，爭得初期確診、早期治療。
腹腔鏡能最大限度的降低手術治療外傷，手術恢復快，手術后疤痕不顯著，其優良的實際效果可減少病人成年人后的心理障礙。
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